Складчина: Школа микробиома. Модуль 1 [PreventAge] [Сергей Ловцевич, Оксана Гезингер и др.]
Лекционный план:
День 1
Спикер: Галимова Ольга
Вводная часть:
- Краткий исторический экскурс: от понятия патогенности к симбиозу
- Основные термины и дефиниции. «Второй геном» человека
- Биология микробиоты: что нужно знать клиницисту
- Функции микробиоты:
- метаболическая функция
- синтез эссенциальных нутриентов
- защита от патогенов
- регуляция иммунитета
- другие функции
- Факторы, влияющие на микробиоту: возраст, диета, антибиотики, стресс и другие
- Программирование микробиоты у плода. Первые 1000 дней жизни человека.
- Различные экологические ниши микробиоты в организме человека. Кишечная микробиота.
- Особенности бактериома, вирома, микома и археома.
Энтеротипы микробиоты. - Строение кишечного барьера и бактериальной биопленки.
Спикер: Гизингер Оксана:
Ось “микробиота-иммунитет”:
- Анатомический контекст: GALT (ассоциированная с кишечником лимфоидная ткань) — самая большая концентрация иммунных клеток в организме.
- Механизмы взаимодействия микробиоты и иммунной системы. Роль КЦЖК, желчных кислот.
- Обучение и «воспитание» иммунитета:
- Роль микробиоты в формировании иммунитета у новорожденных.
- Различие между «стерильными» организмами (germ-free) и нормальными: недоразвитие иммунной системы.
- Распознавание «свой-чужой»:
- PRRs (рецепторы распознавания паттернов): роль TLR, NOD рецепторов.
- Селективная толерантность: почему иммунная система не атакует симбионтов. Понятие иммунотолерантности.
- Клеточный (Treg, Th17) и гуморальный (sIgA) уровни регулирования микробиотой иммунного ответа организма.
- Ось «Микробиота и Нейро — Иммунно — Эндокринная система»
Спикер: Филатова Гульнара
Воспаление как интегративный дирижер:
- Микробиом и системное воспаление
- Проницаемость кишечного барьера (leaky gut)
- Метаболиты микробиоты: от КЦЖК до токсинов
- Ось "кишечник-мозг-иммунитет"
- Микробиом как модулятор воспалительного ответа
- Инструменты — как оценить вклад микробиома с воспалением, как интегрировать с другими анализами, коррекция
Спикер: Ольга Галимова
Обзор методов диагностики микробиоты у взрослых и детей. (экспертная аналитика):
- все используемые в клинической практике методы оценки количественного и качественного состава (культуральные,
- 16-S рРНК, метагеномное секвенирование, FISH, ПЦР (фемофлор/колонофлор/энтерофлор дети и др)
- оценка метаболитов: МСМ микробных маркеров, дыхательные тесты, биохимический анализ кала на определение КЦЖК, органические кислоты в моче.
- аналитика доступности методов, представленных на мировом рынке, существуют ли предпочтения в выборе метода при различных нозологиях. Помощь практикующему врачу в выборе.
- особенности диагностики микробиоты в педиатрии
Спикер: Романов Вячеслав
Лабораторные методы диагностики в различных биотопах — современное состояние, возможности применения.
День 2
Спикер: Ловцевич Сергей
Масс – спектрометрия микробных маркеров в практике клинической, превентивной и интегративной медицины.
1. История развития метода Масс – спектрометрия микробных маркеров
· Масс – спектрометрия как новая технология открывшая возможность развития метода.
· Применения хроматографии и масс – спектрометрии в определении микроорганизмов мировой опыт. Р
· Развитие технологии масс – спектрометрии микробных маркеров Российскими учеными.
2. Масс – спектрометрии микробных маркеров как Метаэкспосомный анализ в исследовании Метаболома человека.
· История развития изучения микроорганизмов.
· Метаболом новые подходы новые термины.
· Значение изучения Метаэкспосома в системе изучения Метаболома человека.
3. Значение Метаэкспосома в развитии различной патологии.
· Как правильно понимать значение Масс – спектрометрии микробных маркеров в практике.
· Важность применения исследования в разных клинических и доклинических технологиях.
4. Работа с бланком анализа выполненного в соответствии с медицинской технологией. Оценка микроэкологического статуса человека методом Хромато — масс – спектрометрии микробных маркеров ФС 2010/038 от 24 февраля 2010 г. (подробный разбор бланка).
5. Обсуждение бланка теста, разработанного совместными усилиями ученых, клиницистов и экспертов Лаборатории микробной хроматографии с использованием метода газовой хроматографии-масс-спектрометрии.
6. В чем принципиальная разница между существующими подходами оценки микробиоты методом масс – спектрометрии в клинической практике.
· Кто сегодня выполняет метод анализ масс-спектрометрии микробных маркеров в России.
· Перечень микроорганизмов разных бланков.
Спикер: Безродный Святослав
Клинический кейс по использованию МСММ
Спикер: Цветикова Софья
Сравнение технологий исследования микробиома:
- Классическая микробиология vs NGS-секвенирование
- Новое поколение: 16S рРНК vs метагеномное секвенирование vs метаболомика. Про эстрогены.
- Проблема восприятия секвенирования в России. Ограниченное количество коммерческих лабораторий. Особенности обработки сырых данных.
Что такое shotgun секвенирование?
- Особенности технологии секвенирования и обработки данных. Разновидности — shallow shotgun (lowWGS) и полный (глубокий) WGS
- Технические возможности и ограничения двух разновидностей:
— ширина таксономии — анализ вирусов, грибов, архей, бактерий
— глубина таксономии — до какого уровня доходим (виды)
— оценка метаболического потенциала
— оценка резистома (гены устойчивости к антибиотикам)
- Вывод — зависимость от типа алгоритмов и обработки данных. Важна клиническая применимость
- Анализ рынка — в РФ только Сербалаб, как выглядит их отчет (просто список всего, что нашлось). В Европе и США другие компании, используют ИИ для обработки.
- Сравнение 16S и WGS — где сильные и слабые места двух технологий. Ключевой вывод — за WGS будущее, но важно, как интерпретируются данные поставщиком услуги.
Спикер: Чухрова Евгения
Правила корректной интерпретации данных о составе микробиома:
- Интерпретация экспертом vs. автоматизация интерпретации
- Технические этапы обработки данных микробиома
- Использование ИИ и других алгоритмов при анализе микробиома
Стоимость 31900 руб.